Gestión Académica

Las técnicas moleculares son imprescindibles actualmente para la estimación de la diversidad en el medio marino, tanto intra como interespecífica. Su conocimiento y utilización práctica es una herramienta de uso creciente en todos los estudios de biodiversidad. Los estudiantes deben conocer sus bases técnicas, saber aplicarlas en la práctica y conocer sus principales aplicaciones. En este contexto, es necesaria la formación básica para poder comprender y aplicar las téccnicas de biología molecular a la gestión y conservación de las especies marinas vivas. La asignatura que se ofrece es fundamentalmente práctica. Los instrumentos para realizar las prácticas y los conocimientos y bibliografía requeridos para su completo desarrollo están disponibles en los Servicios Científico-Técnicos de la Universidad de Oviedo

Se necesitan conocimientos de genética molecular a nivel pregraduado (Introducción a la Genética Molecular). Para los estudiantes que no alcancen el nivel mínimo requerido, se contempla la posibilidad de una pre-formación guiada por profesores a cargo de la asignatura antes del comienzo del curso.

Es imprescindible el conocimiento del idioma inglés.

Los estudiantes aprenderán diversas metodologías modernas de genética y ecología molecular, así como la base teórica y práctica de las herramientas genéticas para su aplicación en el estudio y gestión de los ecosistemas marinos.

El objetivo final es el aprendizaje de técnicas moleculares para su aplicación en la determinaciónn de la diversidad genética, así como en la identificación de unidades taxonómicas y otras aplicaciones de importancia en ciencias marinas. Igualmente se pretende que el estudiante aprenda a manejar las bases de datos públicas para identificación de nuevas técnicas y secuencias y productos de interés en biología molecular.

- Preservación de muestras para el análisis genético. Protocolos de extracción de ADN y ARN. Cuantificación y evaluación de la calidad del ADN y el ARN.
- Amplificación por PCR, diseño del Primers, electroforesis en gel y purificación de PCR. Softwares para el diseño de cebadores. PCR a tiempo real.
- Técnicas de detección de variación del ADN basadas en PCR: loci VNTR, RFLP, AFLP, RAPD, SSCP, SNP.
- Amplificación de microsatélites y análisis de datos.
- Secuenciación de ADN. Software para el análisis, edición y alineación de secuencias.
- Aplicaciones de marcadores genéticos variables al estudio de la estructura genética de la población y el flujo genético.
- Marcadores genéticos invariantes y sus aplicaciones. Identificación de razas y poblaciones. Elaboración de planes para la preservación de poblaciones significativas. Identificación de especies: detección de hibridación, evaluación de poblaciones, detección de fraudes. Desarrollo de marcadores invariantes: secuencias de elección, universalidad.
- Estrategias para desarrollar nuevos marcadores genéticos. Elección de marcadores en función de los objetivos del estudio. Marcadores heterólogos, ventajas y problemas. Marcadores homólogos: de la biblioteca genética al chip de ADN
- Secuenciación de la próxima generación
- Mirando el transcriptoma: aplicaciones
- Bases de datos moleculares en Internet: GenBank, ENSEMBL, SWISSPROT. 

Sesiones teóricas: Todos los temas comienzan con una introducción expositiva por parte de los profesores. Se completan con discusión y análisis crítico de materiales y bibliografía por parte de los estudiantes.

Ejercicios prácticos: Comprenden trabajo de laboratorio y trabajo de ordenador. Ambos son individuales, guiados por los profesores. Durante su realización el estudiante completará un guión o cuaderno de prácticas que le será proporcionado previamente, en el cual responderá a preguntas y cuestiones relevantes relacionadas con las técnicas y procesos que está aprendiendo. Elaborará finalmente un breve informe con las principales conclusiones de la práctica.

De forma excepcional, si las condiciones sanitarias lo requieren, se podrán incluir actividades de docencia no presencial. En cuyo caso, se informará al estudiantado de los cambios efectuados

Asistencia: mínimo 80% de las sesiones

 Evaluación: 40% participación activa en las discusiones de clase. 60%: participación activa, desarrollo y aprovechamiento de las clases prácticas, reflejada en el cuaderno de prácticas y en las conclusiones finales, como así también en el reporte un proyecto corto de investigación. Se considera la evaluación continua, ya que el contacto con los profesores es continuo durante todo el curso.

De forma excepcional, si las condiciones sanitarias lo requieren, se podrán incluir métodos de evaluación no presencial. En cuyo caso, se informará al estudiantado de los cambios efectuados

Páginas web:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

http://www.ebi.ac.uk/embl/

Textos básicos:

Griffiths, A. J. F., Miller, J. H., Suzuki, D. T., Lewontin, R. C. & Gelbart, W. M. (2000). An Introduction to Genetic Analysis. ISBN 0-7167-3520-2, New York: W. H. Freeman Co. Octava edici??n en: Griffiths et al. Introduction to Genetic Analysis Online; http://www.whfreeman.com/iga

Sambrook J, Russel, D. W. (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Ed., ColdSpringHarborLaboratory, New York.

Referencias para los ejercicios prácticos:

Estoup, A., C. R. Largiad??r, E. Perrot and D. Chourrout. 1996. Rapid one-tube DNA extraction for reliable PCR detection of fish polymorphic marker and transgenes. Molecular Marine Biology and Biotechnology 5:295-298.

Hall, T. A. 1999. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series 41:95-98.

Moran P, Garcia-Vazquez E. 2006. Identification of highly prized commercial fish using a PCR-based methodology. Biochemistry and Molecular Biology Education 34: 121-124.